Dans le cadre de découvertes qui ont des implications pour de nouvelles thérapies potentielles contre le VIH, des chercheurs du Texas Biomedical Research Institute (Texas Biomed) ont utilisé des techniques de séquençage génétique sur la version primate non humaine du virus pour identifier que les ganglions lymphatiques abdominaux sont la principale source d’infections rebond dans le premier. semaine après l’arrêt du traitement antirétroviral.
L’étude sur le virus de l’immunodéficience simienne (SIV) a été rapportée dans la revue SMédecine translationnelle scientifique. Le VIS est très étroitement lié au VIH et est souvent utilisé comme indicateur pour étudier le VIH dans des modèles animaux.
« Les tissus lymphatiques sont connus pour être de grands réservoirs de VIH latent », explique le professeur Binhua « Julie » Ling, MD, PhD, de Texas Biomed, auteur principal de l’article. « Cependant, il n’existe aucune preuve définitive qu’ils soient à l’origine du rebond viral initial – c’était une hypothèse. “Nous avons désormais la preuve que le SIV, et donc potentiellement le VIH, se cache dans certains types de ganglions lymphatiques et de tissus de la rate et est parmi les premiers à réapparaître dans le sang après l’arrêt du traitement.”
La thérapie antirétrovirale (TAR) fait un excellent travail en supprimant le VIH à des niveaux indétectables dans le sang. Cependant, de petites quantités de virus latents se cachent dans tout le corps, notamment dans le cerveau, les poumons, les intestins, la rate, les ganglions lymphatiques et d’autres organes. L’arrêt du traitement ouvre la porte à une nouvelle propagation du virus.
« Si nous pouvons identifier le point de départ du rebond du virus, nous pouvons travailler à développer des traitements qui ciblent ces tissus et arrêter la propagation du virus en premier lieu », explique le Dr. Lingue.
Dr. Ling et son équipe ont utilisé plusieurs outils génétiques avancés et techniques de séquençage pour traquer le virus. Ils ont fait équipe avec Brandon Keele, PhD, du programme sur les virus du SIDA et du cancer du Fredrick National Laboratory, qui a créé des virus à codes-barres. Plus de 9 000 virus individuels dans l’inventaire ont des codes-barres génétiques uniques, « comme lorsque vous allez chez Walmart et que chaque article a son code-barres unique à scanner », explique le Dr. Lingue.
Ces virus codés à barres ont été administrés à sept primates non humains. Une fois l’infection détectée, les primates ont commencé un traitement antirétroviral. Après quatre à six mois sous TAR, les animaux présentaient soit des taux très faibles, soit aucun virus détectable dans leur sang, comme chez les personnes séropositives sous TAR. Lorsque le traitement a été interrompu après plus d’un an de TAR, les chercheurs ont pu évaluer les tout premiers stades d’un rebond viral.
Grâce aux virus à code-barres, ils ont pu identifier dans quels tissus le virus s’était multiplié le plus rapidement et s’était le plus répandu sept jours seulement après la fin du traitement. Ils ont comparé les codes-barres les plus couramment trouvés dans le plasma sanguin avec les codes-barres détectés dans des tissus spécifiques. Il est à noter que le test standard n’a pas pu détecter de virus dans le sang après sept jours – les quantités présentes étaient trop faibles pour être détectées – mais un séquençage en profondeur plus sensible l’a pu.
Les chercheurs ont identifié trois principaux coupables : les ganglions lymphatiques mésentériques, situés dans le tissu qui relie les intestins à la paroi abdominale ; la rate, qui fait partie du système lymphatique qui filtre le sang ; et les ganglions lymphatiques inguinaux, situés dans l’aine.
Grâce à des analyses supplémentaires, les chercheurs ont découvert que les lymphocytes T CD4, un type de cellule immunitaire, présents dans les ganglions lymphatiques mésentériques et la rate présentaient des niveaux plus élevés de virus intacts et une activité de réplication plus élevée, ce qui concorde avec des taux plus élevés de virus à codes-barres provenant de ces régions dans le plasma sanguin. correspondait. Cela a été confirmé en utilisant une nouvelle technologie par Qingsheng Li, PhD, de l’Université du Nebraska-Lincoln.
Il est intéressant de noter que certains animaux n’ont montré aucun signe de rebond viral, ce qui suggère qu’ils contrôlaient mieux le virus que d’autres au cours de la première semaine suivant l’arrêt du traitement. Grâce au séquençage unicellulaire et aux analyses transcriptomiques, l’équipe a identifié des gènes intéressants qui contribuent à la dérégulation de la fonction cellulaire normale et pourraient jouer un rôle dans les différences entre les animaux ayant connu un rebond très rapide et les animaux ayant continué à supprimer l’activité virale. Les chercheurs souhaitent en savoir plus sur ces gènes et sur la manière dont ils pourraient influencer la réponse immunitaire des personnes.
Les chercheurs reconnaissent que la taille de l’étude sur sept animaux est petite et que la taille des échantillons de tissus était également limitée. Néanmoins, les résultats suggèrent que des organes importants sont importants pour la recherche de thérapies spécifiques et ciblées.
“Il y a plus de 800 ganglions lymphatiques dans tout le corps”, explique le Dr. Ling. “Savoir quels types de ganglions lymphatiques cibler peut conduire à des thérapies ou des traitements sur mesure et, espérons-le, empêcher la propagation du VIH et prolonger la rémission du VIH.”