Les champignons peuvent provoquer des maladies chez les humains ainsi que chez les animaux et les plantes. Les infections fongiques tuent 1,5 million de personnes chaque année et les infections fongiques des cultures vivrières menacent la production alimentaire. Pour nous protéger, nous avons développé des agents chimiques – sous forme de médicaments ou de pesticides – qui tuent les champignons nuisibles. Le remède le plus efficace contre les infections fongiques est un groupe de substances collectivement appelées Azolés.
“Il est important que les azoles que nous utilisons contre les champignons pathogènes aient un bon effet.”
Ida Skaar, chercheuse principale, Institut vétérinaire norvégien
En fait, les azoles sont largement utilisés – comme médicaments pour les humains et les animaux, pour prévenir les maladies fongiques dans les cultures vivrières et sur les terrains de golf, pour préserver le bois, pour prévenir la moisissure dans les bulbes de fleurs et l’ensilage et pour préserver les plantes ornementales. La liste est longue. Cette utilisation fréquente inquiète les chercheurs car le champignon nuisible développe des résistances.
Un sujet peu recherché
La résistance aux antibiotiques est un problème bien connu qui préoccupe de nombreuses personnes. En comparaison, la résistance aux fongicides est un sujet peu étudié mais très pertinent. L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a distingué ce champignon parmi d’autres organismes. Aspergillus fumigatus comme un champignon pouvant présenter un risque pour la santé à l’avenir. A. fumigatus est un champignon répandu qui présente peu de danger pour les personnes en bonne santé. Les personnes dont le système immunitaire est affaibli peuvent développer des infections qui doivent être traitées. Dans de tels cas, il est important que le médicament, généralement à base d’azoles, soit efficace.
“A. fumigatus « Les anticorps résistants aux azoles constituent un problème mondial croissant », explique Skaar.
« Nous ne savons pas quelle est la situation en Norvège, mais avec le climat plus humide et plus chaud auquel nous pouvons probablement nous attendre à l’avenir, le problème ne fera qu’empirer. »
« Il est absolument nécessaire de connaître la situation en Norvège. Nous devons être proactifs et disposer des connaissances nécessaires avant que le problème ne devienne trop grave. Entre autres choses, nous devons savoir quel est notre degré de résistance, comment le champignon développe une résistance et dans quels environnements la résistance est susceptible de se développer (ce que l’on appelle les hotspots).
One Health – tout est connecté
Skaar dirige le projet NavAzole, qui vise à cartographier et comprendre l’évolution de la résistance aux azoles en Norvège. Cette connaissance est nécessaire pour prendre des décisions intelligentes afin de maintenir les niveaux de résistance aussi bas que possible. Cela nécessite une collaboration entre différents secteurs.
« La résistance aux azoles affecte plusieurs secteurs. Nous devons donc garder à l’esprit la perspective One Health lorsque nous travaillons avec elle. Cela signifie que nous devons reconnaître le lien important entre la santé humaine, la santé animale et l’environnement. “Nous devons considérer tous les domaines d’application des azoles et étudier les points chauds pour le développement de résistances et la manière dont la résistance continue de se propager”, explique le chercheur principal.
Recherche de résistance chez les champignons du sol
L’utilisation de pesticides à base d’azoles en agriculture constitue un point chaud potentiel pour le développement de la résistance. NIBIO abordera ce sujet dans le projet.
Andrea Ficke est chercheuse au NIBIO et travaille sur les maladies fongiques des céréales. Elle explique comment un champ de céréales peut être un point chaud pour le développement de résistances :
“A. fumigatus est un champignon du sol qui est également présent dans les champs. Dans l’agriculture conventionnelle, les plantes sont pulvérisées contre diverses maladies fongiques et de nombreux fongicides sont à base d’azoles. Certains fongicides finissent dans le sol et peuvent avoir des effets nocifs A. fumigatus. Tout comme une utilisation élevée d’antibiotiques peut entraîner le développement d’une résistance chez les bactéries, une exposition régulière aux azoles peut conduire à une résistance. A. fumigatus. “
Dans le cadre du projet, les chercheurs souhaitent donc déterminer s’ils sont résistants A. fumigatus dans les champs de céréales pulvérisés avec des fongicides à base d’azole et s’il existe un lien entre le développement d’une résistance chez les champignons phytopathogènes et le développement d’une résistance chez A. fumigatus.
«Nous étudierons deux champignons responsables de la tache septorienne (Zymoseptoria tritici) et la tache Septoria nodorum (Parastagonospora nodorum). «Ces maladies peuvent entraîner des pertes de récoltes importantes», explique Ficke.
Ficke travaille sur les maladies des taches foliaires chez les céréales depuis 10 à 12 ans. Elle n’a pas observé d’augmentation inquiétante de la résistance aux fongicides au cours de ces années. Le groupe de recherche de Skaar n’a pas encore pu détecter de résistance A. fumigatus Dans les champs. Cela ne signifie pas pour autant que nous pouvons nous reposer sur nos lauriers, bien au contraire.
Le travail préventif est important
« En Norvège, nous avons beaucoup de chance de ne pas avoir de problèmes majeurs de résistance des cultures aux fongicides », déclare Ficke.
Même si Skaar s’est montré plus résilient A. fumigatus Cependant, elle estime que le problème en Norvège est relativement mineur dans d’autres contextes norvégiens que prévu. “Mais il n’est pas nécessaire d’aller plus loin que le Danemark pour que la situation devienne plus grave”, ajoute-t-elle.
Les deux chercheurs soulignent l’importance de se concentrer sur cette question en Norvège.
« Les efforts de prévention que nous entreprenons sont essentiels. Nous devons comprendre l’ampleur du problème en Norvège et prendre des mesures susceptibles de réduire le développement de résistances. Le recours à la lutte antiparasitaire intégrée joue un rôle important à cet égard en réduisant les ravageurs inutiles. » Utilisation de fongicides. Il convient en outre de réfléchir aux situations dans lesquelles l’utilisation de fongicides est nécessaire.»
« La Norvège excelle à éviter l’utilisation inutile d’antibiotiques et nous devrions également nous efforcer d’éviter l’utilisation inutile de fongicides. Une fois la résistance bien installée, il est très difficile de l’éradiquer. « C’est pourquoi nous devons être proactifs », concluent les chercheurs.
Comment les champignons développent-ils une résistance ?
Il existe une certaine variation génétique dans toutes les populations fongiques. Cette variation peut faire en sorte que certains « individus » soient plus tolérants que d’autres à l’exposition aux fongicides. Lorsque la population est exposée à des fongicides, ces « individus » survivent et sont capables de se reproduire. La résistance aux fongicides est génétique et donc héréditaire. Des mutations aléatoires peuvent également se produire dans l’ADN du champignon, le rendant résistant. De cette manière, des champignons de plus en plus résistants sont sélectionnés en utilisant le même type de fongicide sur une période plus longue. Plus les champignons se multiplient rapidement, plus la résistance peut apparaître rapidement.
Différents fongicides ont différentes stratégies pour tuer ou inhiber les champignons. Un « individu » qui a développé une résistance à un type de fongicide n’est pas nécessairement résistant à un fongicide qui agit d’une manière différente. Il est donc important d’éviter l’utilisation unilatérale de fongicides ayant le même mode d’action. En outre, la lutte intégrée contre les ravageurs (IPM) devrait être utilisée dans la production agricole pour réduire le besoin de fongicides (et d’autres pesticides).