Dans une étude récente publiée dans Le microbe du Lancet, Les chercheurs ont examiné la relation entre la composition du microbiote intestinal et le risque d’hospitalisation liée à une infection. À l’aide du séquençage de l’ARNr 16S, ils ont caractérisé la diversité et l’abondance des bactéries intestinales dans deux grandes cohortes indépendantes basées sur la population européenne.

Les résultats de l’étude ont montré que la composition du microbiote intestinal, en particulier l’abondance de bactéries productrices de butyrate, peut protéger contre les infections graves nécessitant une hospitalisation.

Étude : Association entre les bactéries intestinales productrices de butyrate et le risque d’hospitalisation due à des maladies infectieuses : résultats de deux études observationnelles sur le microbiome basées sur la population.  Source de l'image : Drazen Zigic/Shutterstock.comÉtude: Association entre les bactéries intestinales productrices de butyrate et le risque d’hospitalisation dû à des maladies infectieuses : résultats de deux études observationnelles sur le microbiome basées sur la population. Crédit photo : Drazen Zigic/Shutterstock.com

arrière-plan

Malgré les progrès significatifs de la médecine moderne, les maladies infectieuses représentent un fardeau important pour les soins de santé humains. L’étude Global Burden of Disease (2019) estime que près de 25 % de tous les décès annuels pourraient être dus à des infections graves.

Ces résultats suggèrent que les méthodes actuelles de prévention et de traitement sont insuffisantes pour limiter l’impact des maladies infectieuses et que de nouvelles stratégies doivent être développées pour prévenir les infections suffisamment graves pour justifier une hospitalisation et/ou la mort.

Des études récentes menées par les auteurs actuels et d’autres suggèrent que la composition microbienne de l’intestin humain pourrait être étroitement liée à l’immunité contre les infections.

De plus en plus de recherches rapportent que la plupart des patients atteints d’infections sévères présentent des troubles microbiens intestinaux au début de l’hospitalisation (avant le début du traitement, ce dernier aggravant la dysbiose intestinale).

Les modèles murins ont étayé ces observations en associant les infections à une réduction du nombre de bactéries anaérobies dans l’intestin et à une augmentation correspondante de la flore intestinale potentiellement pathogène.

Malheureusement, les données d’origine humaine sont principalement observationnelles, les résultats validés de manière externe et contrôlés géographiquement faisant cruellement défaut dans la littérature.

À propos de l’étude

Des recherches antérieures menées par les auteurs actuels ont signalé une association entre l’épuisement des bactéries intestinales productrices de butyrate et un risque accru d’infections des voies respiratoires chez les patients humains.

La présente étude s’appuie sur ces recherches et émet l’hypothèse que la composition microbienne intestinale et son abondance relative peuvent influencer la susceptibilité d’un individu aux infections graves nécessitant une hospitalisation.

La méthodologie de l’étude et la communication des résultats étaient conformes aux directives de reporting du renforcement de l’organisation et du rapport des études sur le microbiome (STORMS).

Les données de l’étude proviennent de deux grandes cohortes indépendantes basées en Europe : l’étude HELIUS basée aux Pays-Bas et l’étude FINRISK 2002 basée en Finlande. Les deux cohortes étaient des études prospectives nationales liées à l’hospitalisation et à la mortalité.

HELIUS est composé de citoyens néerlandais (âgés de 18 à 70 ans) d’Amsterdam, stratifiés par origine ethnique. FINRISK comprend des échantillons aléatoires d’adultes de six régions finlandaises (âgés de 25 à 74 ans).

Les données ont été collectées à l’aide de questionnaires, d’examens physiques et d’évaluations d’échantillons de selles. Toutes les données ont été liées aux dossiers médicaux et démographiques des participants, qui ont été utilisés pour déterminer les principaux critères de jugement (hospitalisation ou mortalité).

Conformément aux protocoles du Earth Microbiome Project, des échantillons de selles ont été soumis à un séquençage d’ARNr 16S (Illumina) pour déterminer la composition bactérienne intestinale, la diversité α et l’abondance relative (indice de diversité de Shannon).

Les différences de composition de la communauté entre les participants ayant nécessité une hospitalisation et ceux qui n’en ont pas eu besoin ont été évaluées à l’aide d’une analyse de variance multivariée permutationnelle (ANOVA) utilisant la correction des corrections ANCOM-BC (Analyse des compositions du microbiome avec biais).

Résultats de l’étude

La taille combinée des participants des deux cohortes était de 10 699 (HELIUS – 4 248 ; FINRISK – 6 451).

La composition microbienne intestinale de toutes les cohortes était principalement constituée de Firmicutes (Bacillota) et de Bacteroidetes, avec une abondance relative moyenne de 65,9 % et 24,1 %, respectivement. 3,6 % de la cohorte HELIUS et 7,0 % de l’étude FINRISK ont présenté des infections graves au cours de l’étude et du suivi ultérieur (6 ans). Les infections des voies respiratoires inférieures étaient les plus courantes.

Les groupes de résultats (infections graves par rapport aux infections saines) ont montré des séparations dans la composition de la communauté bactérienne intestinale confirmées par des tests de permutation Veillonelle Et Streptocoques La fréquence relative est significativement plus élevée dans le groupe des hospitalisations ou de la mortalité.

En revanche, les participants en bonne santé présentaient une fréquence relative plus élevée de Butyrivibrio, un microbe obligatoire anaérobie producteur de butyrate.

« …ces données ont montré que, dans deux cohortes indépendantes, la composition de base du microbiote intestinal différait entre les participants hospitalisés pour une infection pendant le suivi et ceux sans hospitalisation liée à une infection, indiquant également une augmentation de Veillonella et une diminution de Butyrivibrio anaérobie obligatoire. ” “

Les estimations du rapport de risque proportionnel de Cox ont révélé que l’abondance relative des bactéries productrices de butyrate contribuait directement à réduire le risque d’infections graves. Chaque augmentation de 10 % de l’abondance relative de ces bactéries était associée à un rapport de risque spécifique à une cause (csHR) de 0,75.

Ni les ajustements liés aux facteurs de confusion potentiels (sexe, âge, origine ethnique, consommation d’alcool, tabagisme ou comorbidités) ni la composition du microbiome n’ont modifié ces résultats.

Pris ensemble, ces résultats mettent en évidence l’abondance relative de bactéries productrices de butyrate qui sont directement associées à un risque réduit d’infections nécessitant une hospitalisation ou mortelles.

Participants ayant un indice de masse corporelle (IMC) supérieur à 30 km/m2 étaient l’exception, l’IMC étant la seule variable confondante modifiant ces résultats. En bref, les IMC indiquant l’obésité ont essentiellement éliminé l’association observée.

Conclusions

La présente étude souligne que dans les deux grandes cohortes européennes indépendantes examinées, une fréquence plus élevée de bactéries intestinales anaérobies productrices de butyrate était associée à une réduction significative du risque d’infections graves futures.

Ces résultats suggèrent que le microbiote intestinal est un facteur de risque potentiellement facilement modifiable dans la prévention des infections nécessitant une hospitalisation.

S’ils sont validés par des études interventionnelles, ces résultats pourraient limiter la future susceptibilité humaine aux infections systémiques et informer les cliniciens et les décideurs politiques sur les meilleures interventions nutritionnelles pour prévenir la transmission des contagions au niveau de la population.



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