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Dans une étude récente publiée dans le CDC Maladies infectieuses émergentes Dans la revue, les chercheurs ont caractérisé la physiopathologie de l’infection par l’organisme hautement pathogène du virus de la grippe aviaire (HPAI) A (H5N1), appartenant à la lignée eurasienne et au groupe 2.3.4.4b, chez des animaux terrestres non domestiqués aux États-Unis (US ) entre le 1er avril et le 21 juillet 2022.
L’IAHP A (H5N1) s’est propagée en Europe et aux États-Unis depuis octobre 2021. Le virus, similaire à ceux des souches eurasiennes, a été identifié aux États-Unis en décembre 2021 et s’est propagé aux animaux domestiques et aux oiseaux non domestiques. Le virus reste actif dans les réserves d’oiseaux non domestiques et, en 2021, des foyers et des maladies cliniques surviennent chez de nombreuses espèces animales dans les pays européens.
Étude: Infections par le virus de la grippe aviaire A(H5N1) hautement pathogène du groupe 2.3.4.4b chez des mammifères terrestres sauvages, États-Unis, 2022. Crédit photo : RT Images / Shutterstock
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont présenté une série de cas pour mettre en évidence la physiopathologie des infections spontanées HPAI-H5N1 chez la faune terrestre aux États-Unis, qui ont coïncidé avec des niveaux élevés de virus de la grippe aviaire hautement pathogènes circulant chez les espèces d’oiseaux non domestiques au cours de l’été. et au printemps 2022.
Les cas comprenaient des échantillons opportunistes d’animaux sauvages malades ou morts qui ont été envoyés aux agences nationales de la faune ou aux laboratoires vétérinaires pour diagnostic. Les professionnels de la faune et les vétérinaires, les citoyens et les rééducateurs ont rapporté des observations cliniques. Tous les animaux ont été examinés post mortem par des pathologistes ou des vétérinaires, à l’exception de deux renards roux, qui n’ont fourni que des échantillons ante mortem.
Photographies macroscopiques de lésions post-mortem de renards roux naturellement infectés par le virus hautement pathogène de la grippe aviaire, États-Unis. A) Les poumons ne sont pas collabés et présentent un œdème diffus et des taches roses à rouge foncé. B) Coupe transversale du ventricule gauche montrant une zone focale de pâleur myocardique dans le muscle papillaire (flèches). C) Contenu de l’estomac avec plumes.
Les échantillons post-mortem comprenaient des écouvillons dans des milieux de transfert viral, des échantillons de tissus congelés ou réfrigérés et des tissus conservés dans du formol à 10 %. En plus du total acide nucléique Pour extraire et séparer l’acide ribonucléique (ARN), les chercheurs ont utilisé la réaction en chaîne par polymérase-transcription inverse (RT-PCR) pour cibler le site conservé des gènes matriciels du virus de la grippe A (IAV). L’équipe a effectué deux tests pour le sous-typage H5 du virus de la grippe A : RT-PCR ciblée sur le gène de l’hémagglutinine des sous-types IAV et H5 et RT-PCR ciblée sur le clade 2.3.4.4b du sous-type H5 pour les lignées nord-américaines, eurasiennes et mexicaines du virus. .
Des tests de pathotypage du clade H5 2.3.4.4, des tests de pathotypage rapide ciblés sur la neuraminidase 1 (N1) et des tests de sous-typage N1 ont été effectués pour évaluer les échantillons positifs à l’IAV. L’équipe a construit des arbres d’interprétation phylogénétique et des tableaux de polymorphisme mononucléotidique (SNP) en utilisant une référence comprenant six segments du virus H5N1 clade 2.3.4.4b et deux de virus aviaires non domestiqués des régions du nord des Amériques. Les pathologistes vétérinaires de tous les instituts ont traité des échantillons fixés au formol pour un examen histopathologique. De plus, un examen immunohistochimique monoclonal (IHC) pour la grippe A et le virus de la maladie de Carré (CDV) antigène a été effectuée.
Résultats
L’IAHP a été identifiée chez 67 animaux non domestiqués dans 10 États américains entre avril et juillet 2022, dont 50 renards roux, six mouffettes rayées, quatre ratons laveurs, deux lynx roux, deux opossums de Virginie, un coyote, un pêcheur et un renard gris. Les pathologies les plus courantes chez les animaux infectés étaient la méningo-encéphalite nécrosante, la pneumonie interstitielle et la nécrose cardiaque. L’examen des séquences de 48 animaux montre que ces cas sont dus à des maladies d’oiseaux sauvages.
Le coyote, la mouffette rayée, le renard roux, l’opossum et trois (sur quatre) ratons laveurs étaient des juvéniles, tandis que le lynx roux, le renard gris et le pêcheur étaient des adultes. Il n’y avait aucune préférence de genre au sein de l’espèce biologique. Les mouffettes numérotées de 1 à 5 faisaient partie de deux portées entrées dans des centres de réadaptation, et les wo-opossums et 12 renards roux étaient fortement suspectés ou connus pour être des compagnons de portée. Un vétérinaire ou un rééducateur de la faune a soigné 44 animaux ; Neuf animaux sont morts et 13 ont été euthanasiés sur le terrain. La léthargie, la fièvre, la diarrhée, la perte de conscience, la position couchée, la paralysie et les vomissements sont survenus moins fréquemment.
Deux mouffettes, un renard roux et un lynx roux, ont souffert de détresse respiratoire. Une autopsie macroscopique de 58 animaux a révélé que la plupart des animaux étaient modérément ou bien nourris. Les anomalies pulmonaires étaient constantes, l’hémorragie et la congestion étant les lésions cérébrales les plus courantes. D’autres comprenaient la pâleur, la congestion, l’hypertrophie, l’hémorragie hépatique et la congestion rénale avec hémorragie corticale. L’équipe a rarement observé un épanchement péricardique, une pâleur et des pétéchies dans le tissu myocardique.
Les nématodes étaient fréquents dans les tissus gastro-intestinaux, tandis que d’autres anomalies inhabituelles comprenaient la congestion, les saignements et les selles molles. L’examen histopathologique de 55 animaux a révélé que le lobe frontal était la région cérébrale la plus fréquemment touchée. Le dépistage immunohistochimique de l’antigène de la grippe aviaire sur plusieurs organes de 29 animaux a identifié neuf génotypes H5N1 distincts sur la base des combinaisons uniques de segments génétiques eurasiens et nord-américains. Le virus non utilisé provenant d’un renard roux d’Alaska représentait une introduction distincte du H5N1 2.3.4.4b dans les Amériques, sur la base de recherches phylogénétiques et d’une similarité de séquence avec les virus H5N1 d’origine asiatique dans les huit segments.
Sur la base de cette série de cas, le virus IAHP, une espèce du clade H5 2.3.4.4b de la lignée eurasienne, a été découvert chez des animaux terrestres sauvages aux États-Unis, élargissant ainsi la gamme d’espèces sensibles au virus dans le monde. Plusieurs animaux nord-américains sont susceptibles d’être infectés par le virus HPAI-H5N1 par la consommation d’oiseaux sauvages infectés. La présentation clinique prédominante est constituée de symptômes neurologiques, et l’infection par le virus IAHP doit être considérée comme un diagnostic différentiel par rapport aux autres causes prédominantes de maladie neurologique chez la faune sauvage.
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